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From FastQ to Fasta format[Bash]

2018-10-04 10:15:55     mathildefog     bash fastq fasta 

  Transforme un ficher fastq en fichier fasta.
cat myFile.fastq | paste - - - - | sed 's/^@/>/g'| cut -f1-2 | tr '\t' '\n' > myFile.fasta
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